カントーでハルアがヒジリに出逢ったそのころ。

　ジョウト・ワカバタウンに住むハルアの従弟・ゴールドもまた、不思議な少女を保護していた。

　シルバーという名の少女は、そのままワカバのウツギ博士の元に預けられることとなった。

 

 

　それから3年。 11才になったゴールドは、シルバーと、幼なじみの少年・クリスタルを連れて故郷を旅立つ。

　その道中でロケット団の残党に襲われるも、それを撃退。

　彼らはシルバーを狙っているようだった。

 

 

　その後、自然公園でエリアと名乗る少女と出逢い、彼女を仲間に加えてゴールドたちはジムを巡る。

　しかしシルバーがR団残党に拐われてしまう。

　助けに来るな、と叫ぶ彼女に逆らい、ゴールドたちは彼女を追いかけチョウジへ。

　地下に広がるR団アジトに足を踏み入れると、そこにはチャンピオン・ワタルの姿があった。

　ワタルはR団残党を倒しに来たと言い、ゴールドたちがシルバーを探していると告げると顔色を変え彼らに協力を申し出た。

 

　結果として、チョウジの地下にはシルバーはいなかった。 別の場所へ連れていかれた後だという。

　残党にその所在を吐かせると、彼女はラジオ塔へ連行されたという。

 

　ラジオ塔に辿り着くと、シルバーと、R団ボス・サカキが対峙していた。

　そして明かされる事実。

　シルバーはサカキの娘で、ワタルの妹であるということ。

　シルバーたちは【守護者(ガーディアン)】と呼ばれる一族の末裔であるということ。

　サカキはシルバーの能力を使い、伝説のポケモンを呼び出そうとしていること。

 

　シルバーはそれを嘲笑い、告げた。

「お前に伝説たちを利用されるくらいなら、ここでお前と死ぬ」と。

　彼女はそのままゴールドに自身の手持ちたちを託し、崩壊するビルにサカキと共に残ろうとする。

　しかし寸でのところでシルバーはゴールドに、サカキはワタルによって救出された。

 

　シルバーは語った。

「自分はここでサカキと共に死ぬ運命だった」

　彼女には未来予知の能力があり、それで自身が死ぬ未来を視たのだと言う。

　だがその結末が覆され、新たな未来の分岐が広がった。

　自身の命を願い守ってくれたゴールドたちのために、シルバーは彼らと生きていくことを決意した。

 

 

　こうして、R団残党による事件は幕を閉じたのだった。